Я в самом движке ничего не менял. Только настройки форума, стили и т.д. Ну еще в парочке темплейтов кое чего заменил, но темлейты я так понимаю можно и не трогать, они никакой смысловой нагрузки не несут и отвечают только за отображение.
Если бы знать заранее, поможет такая перезапись или нет. Ты как думаешь?