Димон, никто не заставляет тебя вне сюжета основного что-либо сканировать. Я тебе больше скажу - это сканирование нафиг не нужно, ты можешь купить или найти оружие/броню вполне себе нормальную, а не полагаться на крафт. Плюс технологию Млечного пути ты бушь регулярно получать открыв данный модуль Нексуса (насчет Элея и Реликтов не уверен).
Принудительное сканирование происходит не так часто, чтобы начинать раздражать, хотя имеется и на второстепенных квестах.
И опять повторю - никто не заставляет тебя ходить с включенным сканнером. Когда рядом есть что-то, с чего можно струсить прилично очков сканирования - сканер начинает мигать, тогда и включаешь его.
Точно также можно забить на "добычу" полезных ископаемых - они все покупаются у торговцев за кредиты, которые все равно тратить больше не на что.
Потратить очки нужно на машинку, по крайней мере 2-3 модуля там очень полезны (проходимость-скорость). Остальное лишь немного упростит прохождение игры (мне лично, потому как пушки Млечного пути хороши, но у Реликтов и Элея есть интересные и иногда имбаватые экземпляры).