Все просто - с Денсом после взрыва Института ты снова сможешь ходить, забрав его из бункера (где он проапает себе броню). Но при этом все БС будет тебе враждебно. То есть можешь убить в стычке БС и стрелков сначала стрелков, потом БС, получив и экспы больше, и лута.
Так где тут логика? Ты воюешь на стороне БС, расправляешься с их главным врагом в регионе и после всего этого они становятся тебе враждебны? Или ты мне просто не все рассказал и там это как-то по сюжету все логично объяснили?